Если настройки не сохраняются при перезапуске - скорее всего не установлено автоматическое сохранение настроек. Вызываем меню по F9, затем заходим в System settings и далее выбираем опцию: Auto save setup.

Тема меняется из меню Options → Colors.

Часть стандартных цветов наследуется из настроек и цветовой схемы Windows Terminal (если в качестве оболочки мы используем его).

Неплохое сочетание без вырвиглазных цветов:

Цветовая схема Far Manager: black_from_july
Цветовая схема Windows Terminal: Dark+

Выглядит так:

Отдельно можно настроить цветовую схему редактора через плагин FarColorer.

Идём в Options → Plugin Configuration → Far Colorer → Main Settings → Color Style, где выбираем какую-нибудь схему.

Добавляем в переменную PATH

Далее в терминале:

far.exe

Настроить показ дисковых лейблов: из меню, которое вызывается по ALT + F1 и ALT + 2 нажимаем CTRL + 3 до тех пор, пока степень детализации нас не устроит. Пример.

Посчитать размер папки: фокусируем нужную папку, нажимаем ALT + F3.
Быстро переместиться в какую-либо папку или файл в дереве: Зажимаем ALT + начинаем вводить название.
Переименовать папку: SHIFT + F6.

Если нам требуется всегда запускать Far Manager от администратора и мы используем сетевые диски - нам потребуется их смонтировать в сеансе администратора, т.к. они не будут видны автоматически. Пример подключения диска по сетевому пути.

net use n: "\\Server\Folder" /persistent:yes

При установленном плагине emenu - можно кликнуть на файле\папке ПКМ и получить контекстное меню. Но как вызвать его на клавиатуре?

Здесь было несколько проблем и о них по порядку.

1. На моей TKL-клавиатуре нет отдельной кнопки для вызова меню (решаем ребиндом какой-нибудь клавиши - к примеру, правой Windows). 2. При запуске Far Manager в Windows Terminal - терминал перехватывает нажатие данной клавиши и вызывает собственное контекстное меню.

Решение второй проблемы состоит в том, чтобы удалить данное действие из перечня клавиш Windows Terminal, если оно нам не особенно нужно.